Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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FOXQ1Q9C009 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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FOXQ1Q9C009 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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FOXQ1Q9C009 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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FOXQ1Q9C009 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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FOXQ1Q9C009 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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FOXQ1Q9C009 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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FOXQ1Q9C009 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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FOXQ1Q9C009 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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