Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms