Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 NR1I3-202ENST00000367980 1403 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AL035691.1-201ENST00000434562 595 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 RN7SL152P-201ENST00000484176 298 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 LINC01603-202ENST00000519557 712 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC005070.2-201ENST00000604391 260 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 uc_338.21-201ENST00000622458 147 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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