Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 MAPK10-371ENST00000641952 5209 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 TTC3P1-201ENST00000399586 6081 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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COL24A1Q17RW2 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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COL24A1Q17RW2 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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COL24A1Q17RW2 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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COL24A1Q17RW2 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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COL24A1Q17RW2 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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COL24A1Q17RW2 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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COL24A1Q17RW2 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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