Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms