Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 USP31-201ENST00000219689 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 DNAH2-203ENST00000572933 14955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 TRERF1-205ENST00000541110 7646 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 STAB2-201ENST00000388887 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 TRIOBP-204ENST00000406386 10129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 TSC22D2-201ENST00000361875 11154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CHST6-201ENST00000332272 7957 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 GRIK3-201ENST00000373091 9101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CLASP1-201ENST00000263710 8092 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MUC3A-201ENST00000379458 11226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 PCDHA4-204ENST00000618834 10557 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
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