Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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