Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.1 ms