Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
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TCOF1Q13428 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
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TCOF1Q13428 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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TCOF1Q13428 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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TCOF1Q13428 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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TCOF1Q13428 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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TCOF1Q13428 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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