Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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