Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms