Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA8P53708 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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