Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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