Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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