Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 SLC22A24-202ENST00000417740 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 AL022323.2-201ENST00000623239 3000 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 ZNF169-201ENST00000340911 2336 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 ZNF286A-221ENST00000593105 5222 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 SS18-203ENST00000415083 3414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 IFT122-202ENST00000347300 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 U47924.1-201ENST00000606539 434 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 RBBP8-205ENST00000399725 3260 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 HMSD-201ENST00000408945 2101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 AP4S1-211ENST00000616371 4595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 LINC01427-202ENST00000635258 4566 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 RBMXL1-202ENST00000399794 5084 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 TNFRSF19-204ENST00000403372 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRHP20396 GOSR2-234ENST00000640138 3408 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 MXI1-203ENST00000361248 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 LMCD1-AS1-203ENST00000441861 2683 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 EHF-201ENST00000257831 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 KIAA0319-206ENST00000616673 5315 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 MAATS1-201ENST00000273390 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 ZNF736-202ENST00000423484 7119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 CCDC85C-201ENST00000380243 16393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 FRMPD2-201ENST00000305531 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 ATF7-202ENST00000456903 5218 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 TRPC5-201ENST00000262839 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 ZNF714-201ENST00000425625 2562 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 ABLIM3-201ENST00000309868 4326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 CBFA2T2-209ENST00000492345 7803 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 LINC01105-204ENST00000444416 2695 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 AC130365.1-201ENST00000530524 1553 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 SRSF10-204ENST00000344989 3487 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRHP20396 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 SLF2-203ENST00000370271 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TRHP20396 TTLL6-202ENST00000393382 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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