Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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