Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms