Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LRRIQ1Q96JM4 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms