Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AL365259.1-201ENST00000606334 509 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms