Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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