Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms