Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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