Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
USF2Q15853 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
USF2Q15853 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
USF2Q15853 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
USF2Q15853 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
USF2Q15853 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
USF2Q15853 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
USF2Q15853 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
USF2Q15853 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
USF2Q15853 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
USF2Q15853 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
USF2Q15853 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
USF2Q15853 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
USF2Q15853 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
USF2Q15853 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
USF2Q15853 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
USF2Q15853 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
USF2Q15853 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
USF2Q15853 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
USF2Q15853 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
USF2Q15853 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
USF2Q15853 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
USF2Q15853 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
USF2Q15853 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
USF2Q15853 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
USF2Q15853 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
USF2Q15853 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
USF2Q15853 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
USF2Q15853 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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