Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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RAB39AQ14964 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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RAB39AQ14964 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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