Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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