Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms