Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
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COL4A6Q14031 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
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COL4A6Q14031 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
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COL4A6Q14031 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
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COL4A6Q14031 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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