Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AL356585.10-201ENST00000641883 123 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 TTC33-207ENST00000637375 1824 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PMS2P11Q13670 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms