Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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