Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
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