Protein–RNA interactions for Protein: Q12999

TSPAN31, Tetraspanin-31, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN31Q12999 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TSPAN31Q12999 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.6 ms