Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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