Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPS29P62273 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC002090.1-201ENST00000625000 2138 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC005831.1-201ENST00000624384 1697 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPS29P62273 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.7 ms