Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 PDCL3P1-201ENST00000534575 734 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC022898.1-202ENST00000560864 806 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC100810.3-201ENST00000633189 2240 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 IGKV3D-11-201ENST00000390277 444 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC073188.3-201ENST00000425228 339 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 RN7SL149P-201ENST00000465197 281 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms