Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms