Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AL136298.2-201ENST00000556497 1570 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC022306.1-201ENST00000560489 1562 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 GPR19-201ENST00000332427 1743 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AHSP-201ENST00000302312 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 FABP9-201ENST00000379071 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 IGLJ2-201ENST00000390322 175 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP297-201ENST00000391029 113 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC022730.2-201ENST00000465359 452 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC127024.1-201ENST00000490847 418 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC107956.2-201ENST00000496042 454 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 MIR3689C-201ENST00000581239 72 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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