Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
COG3Q96JB2 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms