Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms