Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
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