Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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NDUFA9Q16795 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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NDUFA9Q16795 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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NDUFA9Q16795 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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NDUFA9Q16795 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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