Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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SYCP1Q15431 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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SYCP1Q15431 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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