Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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