Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms