Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ITGA9Q13797 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms