Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms