Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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FOXE3Q13461 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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