Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 USP32P2-201ENST00000412260 4329 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 PRLR-202ENST00000310101 1297 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 OR5D18-201ENST00000333976 991 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MS4A3-203ENST00000395032 867 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AQP4-203ENST00000440832 1169 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 TDGF1P6-201ENST00000463873 448 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 OR7E161P-201ENST00000533722 967 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RN7SL835P-201ENST00000579920 262 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MIR205HG-210ENST00000603283 455 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MIAT_exon1.1-201ENST00000617016 135 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.27-201ENST00000617573 258 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 JAML-213ENST00000640745 951 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC008498.2-201ENST00000624033 2322 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SF3A3P1-201ENST00000446317 1477 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 PHYHIPL-202ENST00000373880 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MAPK10-354ENST00000641823 2732 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ALG13-201ENST00000251943 3997 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LINC01206-202ENST00000474045 2240 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 GTF2H1-201ENST00000265963 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CABYR-206ENST00000463087 1792 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CDC27-201ENST00000066544 5801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 OR10AD1-201ENST00000310248 1305 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LINC02312-201ENST00000555187 3046 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RSRC2-201ENST00000331738 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MFSD8-227ENST00000641393 4069 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC116351.1-201ENST00000399869 3482 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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