Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHAF1AQ13111 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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