Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 HMGB4-204ENST00000522796 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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