Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN11Q06124 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms